由宗喀巴大师所创、俗称「黄教」的格鲁派，可谓目前影响力最钜的藏传佛教派别；除了先后在拉萨建制了三大寺，被广大信徒奉为信仰中心的大昭寺，目前亦以格鲁派的传承为主。

大昭寺主殿内现供奉著大唐文成公主携来藏地的释迦牟尼十二岁等身像，据闻亲睹其容者能种下「见解脱」因缘，可谓是西藏诸佛像中最为殊圣的一尊，拉萨老城的三条主要转经道：囊廓、八廓和林廓，同样因运而生；而为了落实并宣扬教义，过去僧众也曾依时在此举行别名「莫朗钦波节」的传昭大法会。法会期间，来自哲蚌、色拉、甘丹等三大寺的喇嘛将齐聚礼拜佛祖的十二岁等身像，并在院内广场举行最高等第的「格西拉让巴」考试，通过考验者相当于拿到了佛学博士学位，之后可担任扎仓或寺院的堪布（主持人）。

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另值得一提的是，位于大昭寺上层、外观饰以黄色的小间，乃是过去达赖喇嘛专用的套房，里头布置雅丽非常，又尽显庄严平和的宗教氛围。这里平素并不开放游客参观，只有万千分之一的机会，管事的僧人会打开房门，让躬逢其时的有缘人一窥真颜。